Project TEAM

Project TEAM: "Gene expression profiling of renal cancer stem cells in microenvironmental model of Carcinogenesis" The research is funded by Foundation for Polish Science.

Project Manager: prof. dr hab. n. med. Cezary Szczylik, Military Institue of Medicine

SUMMARY
The unfavorable statistics in patients reflect in part the unsatisfactory understanding of the molecular pathogenesis and progression of renal cancer (RCC). Moreover, unlike colorectal carcinoma, renal tumor progression model has not been elaborated. In the light renal cancer course, elucidating recurrence mechanisms is hence crucial for individualizing and improving treatment and survival of renal cancer patients. At the same time one needs to remember that a single molecular target may be unable to provide sufficient information for drug design, or diagnostic application - instead signaling pathways need to be analyzed simultaneously. In reply to that need and in order to determine the molecular basis of potentially clinically relevant recurrence mechanism, this project is to apply high-throughput (cDNA microarray) analysis and focus on renal cancer stem cells. The second unique feature of the project is the involvement of cancer cell – cell microenvironment interaction analysis in order to approach in vivo complexity. The objective of this study is to explore genetics alterations behind recurrence in renal cancer with the ultimate goal to find new potential drug targets.

RESEARCH HYPOTHESIS: Renal cancer stem cells present molecular properties essential to the metastatic and recurrence processes.

RESEARCH AIM: This study is designed to identify and describe renal cancer stem cells’ (RCC-CSC) gene expression profile. The second aim of the project is to propose recurrence mechanism in RCC.

KEY WORDS: renal cancer, stem cells, cDNA chip, gene expression, prediction, recurrence rate

Tytuł projektu: "Profile ekspresji genów komórek macierzystych raka jasnokomórkowego nerki w modelu mikrośrodowiskowej inwazji nowotworu"

Kierownik projektu: prof. dr hab. n. med. Cezary Szczylik, Wojskowy Instytut Medyczny,Klinika Onkologii

Streszczenie
Niepomyślne statystyki przeżywalności pacjentów w części odzwierciedlają naszą niedostateczną znajomość molekularnych podstaw rozwoju i progresji raka jasnokomórkowego nerki (RCC). Ponadto, w przeciwieństwie do raka jelita grubego, model progresji raka nerki nie został dotychczas opracowany. W obliczu przebiegu choroby u pacjentów z rakiem nerki, wyjaśnienie mechanizmów nawrotu choroby jest konieczne dla zindywidualizowania terapii oraz poprawy efektów leczenia i w efekcie wydłużenia przeżycia pacjentów. Jednocześnie należy pamiętać, iż pojedynczy cel molekularny może nie być wystarczający dla projektowania leków lub diagnostyki, i związku z tym szlaki przekazywania sygnału powinny być analizowane jednoczasowo. W odpowiedzi na ww. wymogi oraz celem wyjaśnienia molekularnych podstaw nawrotu choroby obserwowanego w klinice, projekt ten zakłada wykorzystanie technik wysokowydajnych, jakimi są macierze cDNA w analizie komórek macierzystych raka nerki. Drugim unikalnym celem projektu jest analiza interakcji komórek macierzystych raka z ich mikrośrodowiskiem, co ma stanowić możliwie najlepsze przybliżenie warunków in vivo. Podsumowując celem projektu jest opisanie zmian genetycznych odpowiedzialnych za wznowę raka jasnokomórkowego nerki i wskazanie nowych potencjalnych celów terapii.

Hipoteza badawcza: Właściwości molekularne komórek macierzystych raka nerki decydują o przerzutowaniu i warunkują nawrót choroby nowotworowej.

Cel badania: Identyfikacja i opis profili ekspresji genów komórek macierzystych raka jasnokomórkowego nerki oraz opracowanie molekularnego mechanizmu wznowy w RCC.

Słowa kluczowe: rak nerki, komórki macierzyste, macierz cDNA, ekspresja genów, czynnik predykcyjny, ryzyko wznowy

TEAM
This research seeks to accomplish:
1. Analysis of gene expression pattern in RCC cancer stem cells vs. RCC daughter cells [Anna M. Czarnecka - MD PhD MSc Biotechnology and student 1],
2. Analysis of gene expression pattern in therapy-naive vs. therapy-resistant RCC cancer stem cells [Kumar Sharma - MSc Pharmacology],
3. Analysis of gene expression pattern in RCC stem cells derived from metastatic site vs. derived from a primary cancer site [Mohammed Imran Khan - MSc Bioinformatics],
4. Analysis of RCC stem cells gene expression pattern in microenvironment model - Katarzyna Kamińska - PhD of Agricultural Sciences, student 2],
5. Correlation analysis of gene expression profile and cancer recurrence [Team].

Laureaci VI Edycji Programu TEAM

www.fnp.org.pl

Program został uruchomiony dzięki pozyskaniu przez Fundację środków z funduszy europejskich w ramach Działania 1.2 "Wzmocnienie potencjału kadrowego nauki" Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka 2007-2013.

Wyniki naboru zespołu badawczego do projektu TEAM

Laureaci postępowania rekrutacyjnego wybrani do zespołu badawczego realizującego projekt :"Gene expression profiling of renal cancer stem cells in microenvironmental model of carcinogenesis" - (kierownik projektu prof. dr hab. n. med. Cezary Szczylik) w ramach programu TEAM Fundacji na Rzecz Nauki Polskiej, finansowanego z funduszy strukturalnych Unii Europejskiej, Program Operacyjny Innowacyjna Gospodarka 2007-2013.

Protokół Komisji Rekrutacyjnej z dnia 31 marca 2011 roku

Doktoranci:
mgr Mohammed Imran Khan
mgr Magdalena Buczek

Post-doc
dr Anna Czarnecka
dr Katarzyna Kamińska

Protokół Komisji Rekrutacyjnej z dnia grudnia 2011 roku

Nabór postdoc do projektu TEAM

Wojskowy Instytut Medyczny zatrudni osoby ze stopniem doktora do realizacji projektuTEAM pt.:"Gene expression profiling of renal cancer stem cells in microenvironmental model of Carcinogenesis" finanoswanego przez Fundacje na rzecz Nauki Polskiej.

Nazwa stanowiska: Postdoc w projekcie "Gene expression profiling of renal cancer stem cells in microenvironmental model of Carcinogenesis”
Liczba stypendiów: 2

Instytucja oferująca stypendium (zakład/instytut/wydział/uczelnia/instytucja, miasto):
Wojskowy Instytut Medyczny, Warszawa

Maksymalny czas trwania kontraktu: 4 lata
Data rozpoczęcia pracy: 1 maja 2011
Kwota stypendium: miesięcznie: 5000 PLN
Ubezpieczenie emerytalne i rentowe: TAK

Zadania badawcze:
1. Hodowla komórkowa
2. Analiza ekspresji genów (w tym mikromacierzy cDNA)
3. Analiza statystyczna

Oczekiwania wobec kandydatów:
1. Doktorat w zakresie medycyny, biologii, farmacji, i innych pokrewnych dziedzin
2. Nie dłuższy okres niż 4 lata od uzyskania stopnia doktora (data dyplomu nie sprzed 1 czerwca 2006)
3. Staż naukowy zagraniczny (poza Polską) nie krótszy niż 6 miesięcy
4. Dobra znajomość języka angielskiego
5. Umiejętność pracy w grupie
5. Umiejętność pracy pod presją czasu
6. Wiek poniżej 35 lat

Lista wymaganych dokumentów
1. CV wraz z opisem najważniejszych osiągnięć naukowych
2. List motywacyjny (w języku angielskim)
3. Kopia dyplomu doktora
4. Lista publikacji
5. Potwierdzenie zdania egzaminu językowego (certyfikat lub kopia indeksu)

Dodatkowe informacje o projekcie: http://www.wim.mil.pl

Imię i nazwisko laureata prowadzącego projekt w ramach którego oferowane jest stypendium:
prof. dr n. med. Cezary Szczylik

Adres przesyłania zgłoszeń: team@wim.mil.pl; Faks: (48)22-610-30-98
Termin nadsyłania zgłoszeń: 28 marca 2011

Prosimy o zamieszczenie następującej klauzuli w przesłanej dokumentacji:
"Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych, zawartych w ofercie stypendialnej dla potrzeb niezbędnych dla realizacji procesu rekrutacji, zgodnie z Ustawą z 29.08.97 roku o Ochronie Danych Osobowych Dz.U. nr 133 poz. 883".

Jednostka przedstawiająca ofertę stypendialną zastrzega sobie prawo kontaktu z wybranymi kandydatami.

Post-doc Candidates

PhD holders in medicine, biology, pharmacy or related sciences may apply.
Candidate must be under 35 years of age$ and must have at least 6 months of international
research experience**. His/her PhD diploma must be dated not before 1st June 2006. Following
documents are required:
• Candidate's scientific CV with a short description of his/her scientific achievements
• List of publications
• Personal Statement*
• Copy of PhD Diploma
• English language certificate**.

Application deadline: 28th March 2011
Applications are to be send by e-mail: team@wim.mil.pl or fax: (48)22-610-30-98

*Candidate applying for participation in project must prepare a short (not more than two pages) description (letter-of-intent) of his/her qualifications for the project's execution: he/she should point out how the former education (courses completed, skills acquired) make him/her a person most eligible for the given project. Letter-of-intent should be prepared in English.

**Candidate must have a possibly complete knowledge of English as a working language, certified with appropriate exam certificate(s). The least acceptable certificate will be the FCE/ TOEFL (or equivalent) but priority may be given to candidates who present higher-degree diplomas. Council of Europe Level B2, IELTS of 5.0 and BEC Vantage are considered equivalent to FCE. An exam passed at the University of the Candidate during his/her studies will be considered as equivalent to FCE.

*** International research experience is defined as involvement in research project outside of Poland

The candidates are evaluated in a two-stage process. The first stage is based on the evaluation of the CV and requested documents by project head. In the second stage the candidates who have received the highest evaluations are invited for an interview. The candidates are notified in writing about the results of the recruitment within 14 days after the end of the qualification
procedure.

Nabór doktorantów do TEAM

Wojskowy Instytut Medyczny zatrudni doktorantów do realizacji projektu TEAM pt.:"Gene expression profiling of renal cancer stem cells in microenvironmental model of Carcinogenesis" finansowanego przez Fundację na rzecz Nauki Polskiej.

Nazwa stanowiska: Doktorant w projekcie "Gene expression profiling of renal cancer stem cells in microenvironmental model of Carcinogenesis”
Liczba stypendiów: 2

Instytucja oferująca stypendium (zakład/instytut/wydział/uczelnia/instytucja, miasto):
Wojskowy Instytut Medyczny, Warszawa

Maksymalny czas trwania kontraktu: 4 lata
Data rozpoczęcia pracy: 1 maja 2011
Kwota stypendium: miesięcznie: 3000 PLN
Ubezpieczenie emerytalne i rentowe: TAK

Zadania badawcze:
1. Hodowla komórkowa
2. Analiza ekspresji genów (w tym mikromacierzy cDNA)
3. Analiza statystyczna

Oczekiwania wobec kandydatów:
1. Wykształcenie wyższe pełne w zakresie medycyny, biologii, farmacji, i innych pokrewnych dziedzin
2. Nie dłuższy okres niż 4 lata od ukończenia studiów (data dyplomu nie sprzed 1 czerwca 2006)
3. Dobra znajomość języka angielskiego
4. Umiejętność pracy w grupie
5. Umiejętność pracy pod presją czasu
6. Wiek poniżej 30 lat
7. Ocena „bardzo dobry” na dyplomie ukończenia studiów

Lista wymaganych dokumentów
1. CV wraz z opisem najważniejszych osiągnięć naukowych
2. List motywacyjny (w języku angielskim)
3. Kopia dyplomu ukończenia studiów (wraz z suplementem)
4. Lista publikacji
5. Potwierdzenie zdania egzaminu językowego (certyfikat lub kopia indeksu)
6. List referencyjny od dotychczasowego opiekuna naukowego

Dodatkowe informacje o projekcie: http://www.wim.mil.pl

Imię i nazwisko laureata prowadzącego projekt w ramach którego oferowane jest stypendium:
prof. dr n. med. Cezary Szczylik

Adres przesyłania zgłoszeń: team@wim.mil.pl; Faks: (48)22-610-30-98
Termin nadsyłania zgłoszeń: 28 marca 2011

Prosimy o zamieszczenie następującej klauzuli w przesłanej dokumentacji:
"Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych, zawartych w ofercie stypendialnej dla potrzeb niezbędnych dla realizacji procesu rekrutacji, zgodnie z Ustawą z 29.08.97 roku o Ochronie Danych Osobowych Dz.U. nr 133 poz. 883".
Jednostka przedstawiająca ofertę stypendialną zastrzega sobie prawo kontaktu z wybranymi kandydatami.

PhD Candidates

Graduates of medicine, biology, pharmacy or related sciences may apply.
Candidate must be under 30 years of age$. His/her diploma must be with the grade: very good (or equivalent) and must be dated not before 1st June 2006. Following documents are required:
• Candidate's scientific CV with a short description of his/her scientific achievements
• List of publications
• Reference Letter of scientific supervisor
• Personal Statement*
• Copy of MSc/MD Diploma together with a detailed list of all courses taken and assessed
during the study period (the so-called diploma supplement in case of Polish students).
• English language certificate**.

Application deadline: 28th March 2011
Applications are to be send by e-mail: team@wim.mil.pl or fax: (48)22-610-30-98

*Candidate applying for participation in project must prepare a short (not more than two pages) description (letter-of-intent) of his/her qualifications for the project's execution: he/she should point out how the former education (courses completed, skills acquired) make him/her a person most eligible for the given project. Letter-of-intent should be prepared in English.

**Candidate must have a possibly complete knowledge of English as a working language, certified with appropriate exam certificate(s). The least acceptable certificate will be the FCE/ TOEFL (or equivalent) but priority may be given to candidates who present higher-degree diplomas. Council of Europe Level B2, IELTS of 5.0 and BEC Vantage are considered equivalent to FCE. An exam passed at the University of the Candidate during his/her studies will be considered as equivalent to FCE.

The candidates are evaluated in a two-stage process. The first stage is based on the evaluation of the CV and requested documents by project head. In the second stage the candidates who have received the highest evaluations are invited for an interview. The candidates are notified in writing about the results of the recruitment within 14 days after the end of the qualification
procedure.