Project TEAM

Project TEAM: "Gene expression profiling of renal cancer stem cells in microenvironmental model of Carcinogenesis" The research is funded by Foundation for Polish Science.

Project Manager: prof. dr hab. n. med. Cezary Szczylik, Military Institue of Medicine

SUMMARY
The unfavorable statistics in patients reflect in part the unsatisfactory understanding of the molecular pathogenesis and progression of renal cancer (RCC). Moreover, unlike colorectal carcinoma, renal tumor progression model has not been elaborated. In the light renal cancer course, elucidating recurrence mechanisms is hence crucial for individualizing and improving treatment and survival of renal cancer patients. At the same time one needs to remember that a single molecular target may be unable to provide sufficient information for drug design, or diagnostic application - instead signaling pathways need to be analyzed simultaneously. In reply to that need and in order to determine the molecular basis of potentially clinically relevant recurrence mechanism, this project is to apply high-throughput (cDNA microarray) analysis and focus on renal cancer stem cells. The second unique feature of the project is the involvement of cancer cell – cell microenvironment interaction analysis in order to approach in vivo complexity. The objective of this study is to explore genetics alterations behind recurrence in renal cancer with the ultimate goal to find new potential drug targets.

RESEARCH HYPOTHESIS: Renal cancer stem cells present molecular properties essential to the metastatic and recurrence processes.

RESEARCH AIM: This study is designed to identify and describe renal cancer stem cells’ (RCC-CSC) gene expression profile. The second aim of the project is to propose recurrence mechanism in RCC.

KEY WORDS: renal cancer, stem cells, cDNA chip, gene expression, prediction, recurrence rate

Tytuł projektu: "Profile ekspresji genów komórek macierzystych raka jasnokomórkowego nerki w modelu mikrośrodowiskowej inwazji nowotworu"

Kierownik projektu: prof. dr hab. n. med. Cezary Szczylik, Wojskowy Instytut Medyczny,Klinika Onkologii

Streszczenie
Niepomyślne statystyki przeżywalności pacjentów w części odzwierciedlają naszą niedostateczną znajomość molekularnych podstaw rozwoju i progresji raka jasnokomórkowego nerki (RCC). Ponadto, w przeciwieństwie do raka jelita grubego, model progresji raka nerki nie został dotychczas opracowany. W obliczu przebiegu choroby u pacjentów z rakiem nerki, wyjaśnienie mechanizmów nawrotu choroby jest konieczne dla zindywidualizowania terapii oraz poprawy efektów leczenia i w efekcie wydłużenia przeżycia pacjentów. Jednocześnie należy pamiętać, iż pojedynczy cel molekularny może nie być wystarczający dla projektowania leków lub diagnostyki, i związku z tym szlaki przekazywania sygnału powinny być analizowane jednoczasowo. W odpowiedzi na ww. wymogi oraz celem wyjaśnienia molekularnych podstaw nawrotu choroby obserwowanego w klinice, projekt ten zakłada wykorzystanie technik wysokowydajnych, jakimi są macierze cDNA w analizie komórek macierzystych raka nerki. Drugim unikalnym celem projektu jest analiza interakcji komórek macierzystych raka z ich mikrośrodowiskiem, co ma stanowić możliwie najlepsze przybliżenie warunków in vivo. Podsumowując celem projektu jest opisanie zmian genetycznych odpowiedzialnych za wznowę raka jasnokomórkowego nerki i wskazanie nowych potencjalnych celów terapii.

Hipoteza badawcza: Właściwości molekularne komórek macierzystych raka nerki decydują o przerzutowaniu i warunkują nawrót choroby nowotworowej.

Cel badania: Identyfikacja i opis profili ekspresji genów komórek macierzystych raka jasnokomórkowego nerki oraz opracowanie molekularnego mechanizmu wznowy w RCC.

Słowa kluczowe: rak nerki, komórki macierzyste, macierz cDNA, ekspresja genów, czynnik predykcyjny, ryzyko wznowy

TEAM
This research seeks to accomplish:
1. Analysis of gene expression pattern in RCC cancer stem cells vs. RCC daughter cells [Anna M. Czarnecka - MD PhD MSc Biotechnology and student 1],
2. Analysis of gene expression pattern in therapy-naive vs. therapy-resistant RCC cancer stem cells [Kumar Sharma - MSc Pharmacology],
3. Analysis of gene expression pattern in RCC stem cells derived from metastatic site vs. derived from a primary cancer site [Mohammed Imran Khan - MSc Bioinformatics],
4. Analysis of RCC stem cells gene expression pattern in microenvironment model - Katarzyna Kamińska - PhD of Agricultural Sciences, student 2],
5. Correlation analysis of gene expression profile and cancer recurrence [Team].

Laureaci VI Edycji Programu TEAM

www.fnp.org.pl

Program został uruchomiony dzięki pozyskaniu przez Fundację środków z funduszy europejskich w ramach Działania 1.2 "Wzmocnienie potencjału kadrowego nauki" Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka 2007-2013.